中科院北京基因组研究所重大疾病基因组与个体化医疗实验室介绍

实验室总体定位为针对中科院在十二五期间重点开展人口健康和普惠医疗的重大科研方向，立足肿瘤基因组和重大疾病的基因组学研究，以实验室近期提出的正常与肿瘤细胞突变的群体基因组学研究的创新思路和所获得的重要进展为主要切入点，应用不断更新的高通量基因组学技术和系统生物学研究策略，发挥实验室PI在基因组多态、群体遗传学、表观基因组学、系统生物学等方面的研究优势和成果，力争在肿瘤发生发展机制、肿瘤基因组的基因表达和分子通路网络调控的研究以及若干重大疾病的易感/致病基因定位研究获得重要突破和进展。

组织机构:

实验室主任：曾长青研究员

所属团队：

方向东研究组 郭彩霞研究组 孙英丽研究组 王前飞研究组 吴仲义研究组 杨运桂研究组 曾长青研究组 赵永良研究组

在研项目：

1.体细胞突变和肿瘤细胞发生、转移的群体基因组学；

2.肿瘤组织与微环境的基因表达调控及其分子通路与网络的研究；

3.DNA甲基化、组蛋白修饰和microRNA的表达调控在疾病发生和肿瘤形成与转移中的作用与机制；

4.基因组多态和突变与疾病发生的相关性研究与致病或易感基因定位。

近期发表文章：

◦Tao Y, Ruan J, Yeh S, Lu X, Yu W, Zhai W, Jun Cai J, Lin S, Gong Q, Chong Z, Qu Z, Li Q, Liu J, Yang J, Zheng C, Zeng C, Wang H, Zhang J, Wang S, Hao L, Dong L, Li W, Sun M, Zou W, Yu C, Li C, Liu G, Jiang L, Xu J, Huang H, Li C, Mi S, Zhang B, Chen B, Zhao W, Hu S, Zhuang S, Shen Y, Shi S, Browne C, Whitee K, Chen DS, Chen PJ, Wu CI. Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by a cell-population genetic analysis of whole-genome data. Proc Natl Acad Sci U S A 2011 (accepted)

◦Lu X, Wu CI. Sex, sex chromosomes and gene expression. BMC Biol 2011, 9:30.

◦Wang Q, Wu G, Mi S, He F, Wu J, Dong J, Luo RT, Mattison R, Kaberlein JJ, Prabhakar S, Ji H, Thirman MJ. MLL Fusion Proteins Preferentially Regulate a Subset of Wild Type MLL Target Genes in the Leukemic Genome. Blood 2011 Apr 25. [Epub ahead of print]

◦Lu X, Shapiro JA, Ting CT, Li Y, Li C, Xu J, Huang H, Cheng YJ, Greenberg AJ, Li SH, Wu ML, Shen Y, Wu CI. Genome-wide misexpression of x-linked versus autosomal genes associated with hybrid male sterility. Genome Res. 2010; 20:1097-1102

◦Beall CM, Cavalleri GL, Deng L, Elston RC, Gao Y, Knight J, Li C, Li JC, Liang Y, McCormack M, Montgomery HE, Pan H, Robbins PA*, Shianna KV, Tam SC, Tsering N, Veeramah KR, Wang W, Wangdui P, Weale ME, Xu Y, Xu Z, Yang L, Zaman MJ, Zeng C*, Zhang L, Zhang X, Zhaxi P, Zheng YT. Natural selection on epas1 (hif2alpha) associated with low hemoglobin concentration in tibetan highlanders. Proc Natl Acad Sci U S A 2010; 107:11459-11464. (*corresponding）

◦Zeng C. as one author of the International HapMap 3 Consortium (2010). Integrating common and rare genetic variation in diverse human populations. Nature, 467: 52-58.

◦Tang T, Kumar S, Shen Y, Lu J, Wu ML, Shi S, Li WH, Wu CI. Adverse interactions between micro-RNAs and target genes from different species. Proc Natl Acad Sci U S A 2010; 107:12935-12940.

◦Guo C, Tang TS, Friedberg EC. (2010) Snapshot: Nucleotide excision repair. Cell 140(5): 754-754.e1. Cheng F, Chen W, Richards E, Deng L, Zeng C. SNP@Evolution: a hierarchical database of positive selection on the human genome. BMC Evol Biol 2009; 9:221. (highly accessed article)

联系人和联系方式:

联系人：张大可

E-mail: zhangdk@big.ac.cn

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